O αλγόριθμος Needleman
2. Προσθέτουμε το αμινοξύ (ακ+1) στην αλληλουχία α και
εισαγάγουμε ένα κενό στην αλληλουχία β. Σε αυτή την
Sκ+1,μ+1 = Sκ+1,μ - (gap penalty)
όπου Sκ+1,μ είναι η βαθμολογία που αντιστοιχεί στη βέλτιστη
στοίχιση των αμινοξέων (α1α2…ακ+1) και (β1β2…βμ).