Ανάλυση αλληλουχιών
- Πρόβλεψη λειτουργίας πρωτεϊνών, εύρεση της θέσεως πεπτιδίων-σημάτων (signal peptides), αναγνώριση σημάτων γλυκοζυλίωσης και φωσφορυλίωσης, κοκ.
- Κατηγοριοποίηση πρωτεϊνών σε οικογένειες, και εύρεση χαρακτηριστικών μοτίβων ομολογιών που να μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την ταυτοποίηση τους.
- Πρόβλεψη δευτεροταγούς και τριτοταγούς δομής πρωτεϊνών και RNA.
- Αναγνώριση και ταυτοποίηση γονιδίων σε αλληλουχίες DNA [αρχή και τέλος μετάφρασης, εύρεση πλαισίου ανάγνωσης (reading frame), κοκ].
- Πρόβλεψη αλληλουχίας ώριμου mRNA από το γενομικό DNA (αναγνώριση introns/exons και της θέσεως αποκοπής).