O αλγόριθμος Needleman
Άρα, το μόνο που χρειαζόμαστε για να μπορέσουμε να
υπολογίσουμε όλα τα Sκ,μ (για κάθε τιμή του κ και μ) είναι
αρχικές τιμές για την πρώτη στήλη και πρώτη γραμμή του πίνακα.
Για τον αλγόριθμο Needleman & Wunsch η αρχικοποίηση των
Σημειώστε ότι η αρίθμηση των αλληλουχιών αρχίζει από το 1 (και
κατά συνέπεια το Sκ,0 είναι ίσο με τη βαθμολογία που αντιστοιχεί
στην απλή εισαγωγή κ κενών πριν την αρχή της αλληλουχίας β).