next up previous contents
Next: GROUP 1 : Target Up: The keywords Previous: Command line options   Contents

Input file keywords

A typical input file would look like this :
############################################################
##                                                        ##
##                 Example script for Qs                  ##
##                                                        ##
############################################################

############################################################
#
# Target function definition and
# number of minimisations and steps.
#
TARGET          R-FACTOR
CYCLES          5
STEPS           10000000

############################################################
#
# Annealing schedule & move size control.
# This is for an automatically determined constant 
# temperature run.
#
DETERMINE_BATH
CONSTANT

############################################################
#
# Reflection selection.
#
KEEP            0.70
AMPLIT_CUTOFF   1.0
SIGMA_CUTOFF    2.0
RESOLUTION      15.0 4.0
RANDOM_SELECT   1.0

############################################################
#
# Fraction of reflections for free set.
#
FREE            0.10

############################################################
#
# Files to use for reading model and data.
#
MODEL           model.pdb
DATA            data.hkl

############################################################
#
# Scales, grid, random number generator seed, etc.
#
GRAUTO
SCMODE          wilson
INTERPOLATION   linear
SEED            47579
GLOBAL_B        20.00

############################################################
#
# Log file and postscript-related things.
#
INFO            1000
POSTSCRIPT      colour

############################################################
#
# Finally, cell, space group and molecules per a.u.
#
CELL              27.23   63.66   59.12  90.000  92.900  90.000
GROUP           4
MOLECULES       2
#
#
############################################################

The characters #, ! and space, when they occur at the beginning of a line inform QS to ignore the rest of the line. A complete list of keywords understood by the program follows.



Subsections

NMG, January 2005