Nicholas M. Glykos' group

Προπτυχιακά


Ενεργά μαθήματα


 · Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Εισαγωγής στην Υπολογιστική Βιολογία" του 1ου έτους σπουδών.

 · Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Βιοπληροφορικής" του 3ου έτους σπουδών.

 · Αρχική σελίδα για το μάθημα των "Ειδικών Θεμάτων Βιοπληροφορικής" του 3ου έτους σπουδών.

 · Αρχική σελίδα για το μάθημα των "Ειδικών Θεμάτων Υπολογιστικής Βιολογίας" του 3ου έτους σπουδών.


Μαθήματα παρελθόντων ετών


 · Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Δομικής Βιολογίας" (Δ.Π.Θ. 2003-04, 3ο και 4ο έτος).

 · Αρχική σελίδα για το μάθημα των "Ειδικών Θεμάτων Δομικής Βιολογίας" (Δ.Π.Θ. 2003-04, 3ο και 4ο έτος).

 · Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Εισαγωγής στους υπολογιστές" (Παν/μιο Ιωαννίνων, 2001-02, 2ο έτος).




Μεταπτυχιακά


 · Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Βιοπληροφορικής" (Δ.Π.Θ.).

 · Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Μακρομοριακής Κρυσταλλογραφίας" (Παν/μιο Κρήτης).

Συγγράμματα


 · «Μία μη μαθηματική εισαγωγή στην κρυσταλλογραφία πρωτεϊνών». Αυτό είναι ένα ελεύθερο, ανοικτό και άμεσα διαθέσιμο ηλεκτρονικό βιβλίο. Αρπάξτε το τώρα που είναι ζεστό : PDF (9.5 Mbytes). Η σελιδοποίηση είναι τέτοια ώστε να διαβάζεται εύκολα ακόμα και σε πολύ μικρές οθόνες (π.χ. ενός phablet). Το βιβλίο είναι επίσης διαθέσιμο σε μορφή epub μέσω του Εύδοξου και του Κάλλιπου.

 · Μεταφράσαμε στα Ελληνικά το βιβλίο των Branden & Tooze "Introduction to Protein Structure" ("Εισαγωγή στη Δομή των Πρωτεϊνών" τώρα πια). Ένα δείγμα από το βιβλίο (το κεφάλαιο 8) είναι διαθέσιμο με τη μορφή αρχείου PDF (4.7 MBytes).




Εκπαιδευτικό λογισμικό


Ετοιμάσαμε μία εξαιρετικά μικρή και βολική διανομή του GNU/Linux για τις διδακτικές ανάγκες δύο προπτυχιακών μαθημάτων. Η διανομή είναι βασισμένη στο tinycore linux πράγμα που επιτρέπει μέσα σε μόλις 60 MBytes να χωρέσει ένα πλήρες προγραμματιστικό περιβάλλον unix με κέλυφος, κειμενογράφους, gcc, perl, ssh, έναν απλοϊκό web browser (links), μέχρι και rasmol και ένα πρόγραμμα για x-y plots (screenshot). Αρπάξτε το τώρα που είναι ζεστό (σύντομες οδηγίες εδώ) :

 ·  Windows XP, 7, 8 : κατεβάστε αυτό το zip αρχείο tinycore.zip, κάντε εξαγωγή των αρχείων, τρέξτε το αρχείο με το όνομα START.

 ·  Windows 10 : η Microsoft σας έχει έτοιμο Linux (!). Ακολουθήστε αυτόν τον οδηγό εγκατάστασης.

 ·  MacOSX : κατεβάστε αυτό το συμπιεσμένο tar αρχείο tinycore.tgz, κάντε εξαγωγή των αρχείων (εάν χρειάζεται), τρέξτε το αρχείο με το όνομα START.

 ·  Linux : εάν θέλετε να δείτε με τι μοιάζει το tinycore, κάντε εγκατάσταση του qemu, κατεβάστε αυτό το αρχείο tinycore.img, και τρέξτε το από το κέλυφος με κάτι σαν qemu-system-x86_64 -m 256 tinycore.img.