Προπτυχιακά
Ενεργά μαθήματα
• Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Εισαγωγής στην Υπολογιστική Βιολογία" του 1ου έτους σπουδών.
• Αρχική σελίδα για το μάθημα των "Ειδικών Θεμάτων Υπολογιστικής Βιολογίας" του 2ου έτους σπουδών.
• Αρχική σελίδα για το μάθημα των "Ειδικών Θεμάτων Βιοπληροφορικής" του 3ου έτους σπουδών.
Μαθήματα παρελθόντων ετών
• Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Βιοπληροφορικής" (Δ.Π.Θ. 2003-2018, 3ο έτος).
• Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Δομικής Βιολογίας" (Δ.Π.Θ. 2003-2004, 3ο και 4ο έτος, Δ.Π.Θ. 2018, 3ο έτος).
• Αρχική σελίδα για το μάθημα των "Ειδικών Θεμάτων Δομικής Βιολογίας" (Δ.Π.Θ. 2003-2004, 3ο και 4ο έτος).
• Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Εισαγωγής στους υπολογιστές" (Παν/μιο Ιωαννίνων, 2001-2002, 2ο έτος).
Μεταπτυχιακά
Ενεργά μαθήματα
• Αρχική σελίδα για το μάθημα "UNIX και Αρχές προγραμματισμού" του MSc "Applied Bioinformatics and Data Analysis" (Δ.Π.Θ.).
• Αρχική σελίδα του μαθηματος της "Εισαγωγής στην Υπολογιστική Δομική Βιολογία" του MSc "Quantum Computing and Quantum Technologies" (Δ.Π.Θ.).
• Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Βιοπληροφορικής" του MSc "Μεταφραστική Έρευνα στην Βιοϊατρική" (Δ.Π.Θ.).
Μαθήματα παρελθόντων ετών
• Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Βιοπληροφορικής" του MSc "Εργαστηριακή έρευνα στη Μοριακή Βιολογία" (Δ.Π.Θ., 2018)
• Αρχική σελίδα για το μάθημα της "Μακρομοριακής Κρυσταλλογραφίας" του MSc "Πρωτεϊνική Βιοτεχνολογία" (Παν/μιο Κρήτης, 2003-2017).
Συγγράμματα
• «Μία μη μαθηματική εισαγωγή στην κρυσταλλογραφία πρωτεϊνών». Αυτό είναι ένα ελεύθερο, ανοικτό και άμεσα διαθέσιμο ηλεκτρονικό βιβλίο. Αρπάξτε το τώρα που είναι ζεστό : PDF (8.3 Mbytes). Η σελιδοποίηση είναι τέτοια ώστε να διαβάζεται εύκολα ακόμα και σε πολύ μικρές οθόνες (π.χ. ενός phablet). Το βιβλίο είναι επίσης διαθέσιμο σε μορφή epub μέσω του Εύδοξου και του Κάλλιπου.
• Μεταφράσαμε στα Ελληνικά το βιβλίο των Branden & Tooze "Introduction to Protein Structure" ("Εισαγωγή στη Δομή των Πρωτεϊνών" τώρα πια). Ένα δείγμα από το βιβλίο (το κεφάλαιο 8) είναι διαθέσιμο με τη μορφή αρχείου PDF (4.7 MBytes).
Εκπαιδευτικό λογισμικό
Για τις ανάγκες δύο προπτυχιακών μαθημάτων (αυτό και αυτό) απαιτείται πρόσβαση σε ένα υγιές περιβάλλον προγραμματισμού βασισμένο σε linux. Έχουμε ετοιμάσει οδηγίες και προγράμματα που παρέχουν ένα τέτοιο περιβάλλον για τα ακόλουθα λειτουργικά συστήματα :
• Windows 11 και 10 : ακολουθήστε αυτόν τον οδηγό εγκατάστασης.
• Android : αναλυτικές οδηγίες για κινητά και tablets android από αυτόν τον οδηγό εγκατάστασης.
• MacOS : για εκδόσεις του MacOS >= 11.0, ακολουθήστε αυτόν τον οδηγό εγκατάστασης. Για πιο παλιές εκδόσεις, κατεβάστε αυτό το συμπιεσμένο tar αρχείο tinycore.tgz, κάντε εξαγωγή των αρχείων (εάν χρειάζεται), τρέξτε το αρχείο με το όνομα START. Οδηγιες εδώ.
• Windows XP, 7, 8, 10 (32bit) : κατεβάστε αυτό το zip αρχείο tinycore.zip, κάντε εξαγωγή των αρχείων, τρέξτε το αρχείο με το όνομα START. Οδηγιες εδώ.
• Linux : εάν θέλετε να δείτε με τι μοιάζει το tinycore, κάντε εγκατάσταση του qemu, κατεβάστε αυτό το αρχείο tinycore.img, και τρέξτε το από το κέλυφος με κάτι σαν qemu-system-x86_64 -curses -m 512 -smp cores=2 tinycore.img Οδηγιες εδώ.
Οι τρεις τελευταίες κατηγορίες βασίζονται στο tinycore linux. Για πιο πρόσφατες εκδόσεις αυτών των συστημάτων, δείτε εδώ.